次氯酸鈉是一種強氧化劑,消毒作用與液氯相同。次氯酸鈉溶液不穩定,其所含有效氯成分易受日光、溫度的作用而游離揮發,難以貯存和運輸，所以一般很少用次氯酸鈉溶液投加,而采用次氯酸鈉發生器。并且，次氯酸鈉溶液還可用來生產加工84消毒水等消毒劑產品。
因此大部分次氯酸鈉消毒是利用商品次氯酸鈉溶液或是現場制備的次氯酸鈉溶液作為消毒劑,對污水消毒。盡管液氯使用方便等優點,但是由于氯氣是一種極毒的化學元素,一旦發生泄漏事故,后果十分嚴重。有些地方液氯供應也有一定困難,因此,在人口稠密地區、消毒站和污水站距離較近及沒有液氯供應的地方宜采用次氯酸鈉消毒。并且，次氯酸鈉溶液不能長時間貯存,應當隨時產生隨時使用,夏天貯存期不得超過1~2天,冬天避光貯存也不得超過5~7天。
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