次氯酸鈉廣泛用于包括自來水、中水、工業循環水、游泳池水、醫院污水等等各種水體的消毒。并且次氯酸鈉是一種強堿弱酸鹽，因此對皮膚黏膜以及呼吸道黏膜具有很強的灼傷作用，尤其是次氯酸鈉和酸反應可以生成氯氣，氯氣經過皮膚黏膜或者呼吸道黏膜，以及的眼結膜等可以造成嚴重的灼傷，所以次氯酸鈉盡量不要跟酸一塊使用。另外，漂白粉主要成分就是次氯酸鈉，但是水中的次氯酸鈉含量是很低的，所以對人體的危害程度也是極輕微的，可以忽略不計，主要是注意在消毒殺菌過程中次氯酸鈉的濃度不能過高，以免對人體造成損害
因為次氯酸鈉本身是一種常用的漂白劑，在家庭使用的時候要注意，比如84消毒劑里面含有這些東西，在這時候如果是再用廁所里面用的潔廁靈，里面主要是鹽酸，兩個混合在一起會產生氯氣，氯氣是有劇毒的，所以說一定要避免次氯酸鈉和鹽酸的接觸，這是非常重要的。
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