兩者使用過程對比：
二氧化氯消毒劑使用濃度小，氣味柔和，對設備幾乎無腐蝕，對皮膚不刺激，使用后可以不沖洗;次氯酸鈉消毒劑使用濃度大，氣味強,對設備有強腐蝕性，對皮膚也有強刺激作用，使用后需用大量沖洗用水，易殘留。
兩者穩定性對比:
次氯酸鈉水溶液具有不穩定性，常常受到環境溫度、溶液、PH值以及存放時間等因素影響;而二氧化氯由二氧化氯發生器制備，現用現配。
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