1、使用次氯酸鈉消毒要選用適宜的殺菌濃度，謹防走入“濃度越高效果越好”的誤區，因為高溫、 高濃度可使其迅速衰減，影響消毒效果。
2、次氯酸鈉不宜長時間貯存。受光照、 溫度等因素的影響，有效氯容易揮發。 市面上有一種次氯酸鈉發生器，可現利現用，能夠有效地提高消毒效果。
3、使用次氯酸鈉消毒受水PH值的影響，水的PH 值越高，其消毒效果越差。
4、次氯酸鈉對金屬等有腐蝕作用， 使用時要注意防腐安全。
5、使用次氯酸鈉消毒， 要清除物件表面上的有機物質，因為有機物可能消耗有效氯，降低消毒效果。
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